01-執行標準不同
實驗室超純水機執行《分析實驗室用水規格和試驗方法(GB/T 6682-2008)》，判定水質的主要參數為TOC、熱源、電導率等；
家用純水機執行《生活飲用水衛生標準（GB5749-2006）》，判定水質的主要參數是色度、濁度、余氯、TDS值等
02-工作原理不同
實驗室超純水機是利用反滲透技術和離子交換技術，在各級濾芯、控制元件、增壓泵、紫外燈等的共同作用下，制得符合實驗要求的純水、超純水；
家用純水機是通過五級濾芯的過濾，濾除細菌（0.4-1μm）、病毒(0.4-0.02μm)、重金屬離子等有害物質，制得達到生飲標準的飲用水。一般而言，純水、超純水比飲用水純凈，電導率也更低。
03-工藝流程不同
實驗室超純水機的純化系統主要由預處理系統、反滲透系統、超純化系統組成，屬于離子級過濾。原水通過預處理系統，去除異味、大顆粒物質、大部分雜質；再經反滲透系統，進行純化脫鹽處理制得純水；最后經超純化系統，制得超純水。為滿足用戶的多樣化需求，超純水機還有軟水器、微濾膜、UV紫外消解儀等可供選配。
家用純水機通常有五級濾芯，依次為PP棉、顆粒活性炭、精密壓縮活性炭、RO膜/超濾膜、后置活性炭，屬于分子級過濾。
04-應用領域不同
實驗室超純水機早已成為生物、電子、制藥、化工等實驗室的標配，其制取的純水、超純水廣泛應用于細胞培養、質譜分析、器皿清洗、超痕量分析等。
家用純水機在生活中較為常見，可去除有害物質，保留微量元素、礦物質。凈化后的水呈弱堿性，清甜可口，可直接飲用。
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